Co-responsables : Gisèle Bonne & Valérie Allamand
Les thèmes de recherche de l’équipe se concentrent sur 2 groupes de maladies neuromusculaires (MNM) : les myopathies dues aux anomalies de la Myomatrice [collagène de type VI & maladies de la matrice extracellulaire (Allamand et al. 2011, Skelet Muscle; groupe de V Allamand] et du Myonucleus [dystrophie musculaire d’Emery-Dreifuss (EDMD) & autres laminopathies du muscle strié (SML)) dues aux mutations du gène LMNA codant pour des lamines de type A ou des gènes codant pour des composants liés à la membrane nucléaire (Bertrand et al. 2011, Biochem Soc Trans.; Azibani et al. 2014, Semin Cell Dev Biol; Groupe de G Bonne/ AT Bertrand)]. Ces myopathies présentant des rétractions importantes partagent certaines caractéristiques cliniques et peuvent faire l’objet d’un diagnostic différentiel.
Ces pathologies sont très hétérogènes, à la fois cliniquement et génétiquement, et aucun traitement n’est encore disponible. Nos activités antérieures ont conduit à l’identification d’anomalies génétiques, au développement d’outils (modèles cellulaires et animaux) et au décryptage des mécanismes physiopathologiques pour une meilleure compréhension des bases moléculaires et l’identification de cibles thérapeutiques. De nombreux problèmes restent non résolus: 1) l’absence de diagnostic moléculaire pour un sous-ensemble de patients, 2) la fonction précise des protéines impliquées et les mécanismes physiopathologiques sous-jacents… Plusieurs points communs (dysfonctionnement contractile, défauts de la mécanobiologie, fibrose…) ont été et sont toujours abordés de manière transversale par la mise en commun de nos compétences spécifiques (enveloppe nucléaire, nucléoplasme, matrice extracellulaire…).
Le projet de l’équipe s’articule autour de 3 axes
1. définir le spectre génétique et clinique ainsi que l’histoire naturelle de ces MNM ;
2. étudier les mécanismes physiopathologiques des mutations géniques qui induisent ces affections des muscles cardiaques et / ou squelettiques avec pour objectif :
3. identifier et de tester des pistes thérapeutiques pour ces affections. Ceci est effectué sur du matériel biologique provenant de patients (ADN, ARN, cellules en culture et biopsies) ainsi que sur les divers modèles animaux que nous avons développés.
Composition de l’équipe
G Bonne, DR1, Co-responsable d’équipe
V Allamand, DR2, Co-responsable d’équipe
A Bertrand, CR
M Leconte, PhD student
A Garnier, IE
P Maurissens, IE
I Nelson, IR AIM
C Gartioux, IE
A Gomis, IE
D Kourtzas, PhD Student
L Benarroch, Post-doc
Activités Transversales
Expertise clinique
Dr F Leturcq, PH
Dr C Métay, PH
Dr T Stojkovic, PH
Registres et bases de données
Dr R Ben Yaou, PH
K Chikhaoui, IE
A Atalaia, Post-doc
Histopathologie
Dr T Evangelista, PH
Filnemus – Section recherche
G Palma, IE
Contacts
Gisèle Bonne (g.bonne@institut-myologie.org)
Valérie Allamand (v.allamand@institut-myologie.org)
Anne Bertrand (a.bertrand@institut-myologie.org)
Axes de projets
- Spectre clinique et génétique des maladies liées à la Myomatrix et au Myonucleus : à l’aide de techniques de séquençage nouvelle génération (WES, WGS, RNA-seq) nous poursuivons l’identification de nouveaux gènes et variants pour les patients orphelins du diagnostic moléculaire en interaction étroite avec le Centre de références pour les MNM Paris-Nord/Est/Ile de France (B Eymard), le réseau Filnemus, l’ERN Euro-NMD ainsi que le consortium européen Solve RD (H2020 grant 2018-2022). Le but de cet axe est finalement de transférer les connaissances acquises vers des procédures de diagnostic dans des laboratoires de référence (par exemple l’unité fonctionnelle de Cardio-& Myogénétique, Hôpital de la Pitié-Salpêtrière; le laboratoire de Biochimie et & de Génétique moléculaire, Institut Cochin).
- Histoire naturelle de ces maladies via des registres de patients nationaux et internationaux : nous élargissons encore le recrutement / l’inclusion de patients dans des registres nationaux et internationaux et explorons de manière approfondie l’histoire naturelle de notre maladie d’intérêt afin d’identifier les résultats de diagnostic et de pronostic et les biomarqueurs.
- Décrypter la structure et la fonction de la Myomatrix et du Myonucleus en santé et en maladie : en utilisant les différents modèles cellulaires et animaux disponibles ainsi que de nouveaux modèles, le cas échéant, nous avons pour objectif de décrypter plus avant la structure et la fonction des protéines actuellement connues, mais aussi des nouveaux candidats identifiés par nos investigations, à savoir les lamines de type A et les composants de l’enveloppe nucléaire associés, le collagène VI et les composants de la matrice extracellulaire associés. En particulier, les voies de signalisation et les mécanismes moléculaires pathologiques sont étudiés afin d’identifier des cibles thérapeutiques pertinentes et innovantes.
Ces différents axes de recherche, à visée translationnelle avec des bénéfices pour le patient, nous permettent d’identifier et de caractériser de nouveaux gènes, des spectres phénotypiques, des mécanismes pathologiques associés et des cibles thérapeutiques.
Nos dernières publications
- Bhaskaran A, Ben Yaou R, Helms AS, Fayssoil A, Richard P, Stojkovic T, Anselme F, Labombarda F, Chikhaoui C, De Sandre-Giovannoli A, Jeru I, Leturcq F, Vigouroux C, Dembele M, Elliott P, Savvatis K, Zeppenfeld K, Bouguerra H, Charron P, Kumar S, Bonne G, Wahbi K, Lakdawala NK. Location of LMNA Variants and Clinical Outcomes in Cardiomyopathy. JAMA Cardiol. 2025 Jul 2:e252069. doi: 10.1001/jamacardio.2025.2069.
- He M, Ding M, Chocholouskova M, Chin CF, Engvall M, Malmgren H, Wagner M, Lauffer MC, Heisinger J, Malicdan MCV, Allamand V, Durbeej M, Delgado-Vega AM, Sejersen T, Nordgren A, Torta F, Silver DL. SPNS1 variants cause multi-organ disease and implicate lysophospholipid transport as critical for mTOR-regulated lipid homeostasis. J Clin Invest. 2025 Jul 3:e193099. doi: 10.1172/JCI193099.
- Jacob M, Kölbel H, Harrer P, Kopajtich R, Munot P, Achleitner MT, Badmann S, Brugger M, Brunet T, Bonne G, Codina M, Ebner L, Eshraghi P, Eyring K, Farhat AS, Feichtinger RG, Graf E, Marcé-Grau A, Hahn A, Houlden H, Karimiani EG, Manel V, Mayerhanser K, Nectoux J, Nelson I, Phadke R, Prokisch H, Sadeghian S, Saparov A, Schänzer A, Schara-Schmidt U, Schmidt J, Schuler R, Sewry C, Shariati G, Slanz S, Smirnov D, Sukenik-Halevy R, Tajsharghi H, Toosi MB, Trujillano L, Weis J, Wilson LC, Ben Yaou R, Zamani M, Zech M, Zschüntzsch J, Kornak U, Goméz-Andrés D, Maroofian R, Winkelmann J, Roos A, Distelmaier F, Mayr JA, Wagner M. Deciphering DST-associated disorders: biallelic variants affecting DST-b cause a congenital myopathy. Brain. 2025 Jun 11:awaf227. doi: 10.1093/brain/awaf227.
- De Winter J, Van de Vondel L, Ermanoska B, Monticelli A, Isapof A, Cohen E, Stojkovic T, Hackman P, Johari M, Palmio J, Waldrop MA, Meyer AP, Nicolau S, Flanigan KM, Töpf A, Diaz-Manera J, Straub V, Longman C, McWilliam CA, Orbach R, Verma S, Laine R, Donkervoort S, Bonnemann CG, Rebelo A, Züchner S, Grider T, Shy ME, Maystadt I, Demurger F, Cairns A, Beecroft S, Folland C, De Ridder W, Ravenscroft G, Bonne G, Udd B, Baets J. Heterozygous loss-of-function variants in SPTAN1 cause an early childhood onset distal myopathy. Genet Med. 2025 Jun;27(6):101399. doi: 10.1016/j.gim.2025.101399.
- Foley AR, Bolduc V, Guirguis F, Donkervoort S, Hu Y, Orbach R, McCarty RM, Sarathy A, Norato G, Cummings BB, Lek M, Sarkozy A, Butterfield RJ, Kirschner J, Nascimento A, Natera-de Benito D, Quijano-Roy S, Stojkovic T, Merlini L, Comi G, Ryan M, McDonald D, Munot P, Yoon G, Leung E, Finanger E, Leach ME, Collins J, Tian C, Mohassel P, Neuhaus SB, Saade D, Cocanougher BT, Chu ML, Scavina M, Grosmann C, Richardson R, Kossak BD, Gospe SM Jr, Bhise V, Taurina G, Lace B, Troncoso M, Shohat M, Shalata A, Chan SHS, Jokela M, Palmio J, Haliloğlu G, Jou C, Gartioux C, Solomon-Degefa H, Freiburg CD, Schiavinato A, Zhou H, Aguti S, Nevo Y, Nishino I, Jimenez-Mallebrera C, Lamandé SR, Allamand V, Gualandi F, Ferlini A, MacArthur DG, Wilton SD, Wagener R, Bertini E, Muntoni F, Bönnemann CG. Characterization of severe COL6-related dystrophy due to the recurrent variant COL6A1 c.930+189C>T. Brain. 2025 Apr 3:awaf116. doi: 10.1093/brain/awaf116.
- Laurie S, Steyaert W, de Boer E, Polavarapu K, Schuermans N, Sommer AK, Demidov G, Ellwanger K, Paramonov I, Thomas C, Aretz S, Baets J, Benetti E, Bullich G, Chinnery PF, Clayton-Smith J, Cohen E, Danis D, de Sainte Agathe JM, Denommé-Pichon AS, Diaz-Manera J, Efthymiou S, Faivre L, Fernandez-Callejo M, Freeberg M, Garcia-Pelaez J, Guillot-Noel L, Haack TB, Hanna M, Hengel H, Horvath R, Houlden H, Jackson A, Johansson L, Johari M, Kamsteeg EJ, Kellner M, Kleefstra T, Lacombe D, Lochmüller H, López-Martín E, Macaya A, Marcé-Grau A, Maver A, Morsy H, Muntoni F, Musacchia F, Nelson I, Nigro V, Olimpio C, Oliveira C, Paulasová Schwabová J, Pauly MG, Peterlin B, Peters S, Pfundt R, Piluso G, Piscia D, Posada M, Reich S, Renieri A, Ryba L, Šablauskas K, Savarese M, Schöls L, Schütz L, Steinke-Lange V, Stevanin G, Straub V, Sturm M, Swertz MA, Tartaglia M, Te Paske IBAW, Thompson R, Torella A, Trainor C, Udd B, Van de Vondel L, van de Warrenburg B, van Reeuwijk J, Vandrovcova J, Vitobello A, Vos J, Vyhnálková E, Wijngaard R, Wilke C, William D, Xu J, Yaldiz B, Zalatnai L, Zurek B; Solve-RD DITF-GENTURIS; Solve-RD DITF-ITHACA; Solve-RD DITF-EURO-NMD*; Solve-RD DITF-RND; Solve-RD consortium; Brookes AJ, Evangelista T, Gilissen C, Graessner H, Hoogerbrugge N, Ossowski S, Riess O, Schüle R, Synofzik M, Verloes A, Matalonga L, Brunner HG, Lohmann K, de Voer RM, Töpf A, Vissers LELM, Beltran S, Hoischen A. Genomic reanalysis of a pan-European rare-disease resource yields new diagnoses. Nat Med. 2025 Feb;31(2):478-489. doi: 10.1038/s41591-024-03420-w. * Allamand V, Ben Yaou R, Bonne G, Stojkovic T, members of Euro NMD DIFT).
- Benarroch L, Bonne G, Rivier F, Procaccio V, Hamroun D. The 2025 version of the gene table of neuromuscular disorders (nuclear genome). Neuromuscul Disord. 2025 Jan;46:105261. doi: 10.1016/j.nmd.2024.105261.
- Leconte M, Bonne G, Bertrand AT. Recent insights in striated muscle laminopathies. Curr Opin Neurol. 2024 Oct 1;37(5):509-514. doi: 10.1097/WCO.0000000000001297.
- Benarroch L, Bonne G, Rivier F, Hamroun D. The 2024 version of the gene table of neuromuscular disorders (nuclear genome). Neuromuscul Disord. 2024 Jan;34:126-170. doi: 10.1016/j.nmd.2023.12.007.
- Pereira CD, Espadas G, Martins F, Bertrand AT, Servais L, Sabidó E, Chevalier P, da Cruz E Silva OAB, Rebelo S. Quantitative proteome analysis of LAP1-deficient human fibroblasts: A pilot approach for predicting the signaling pathways deregulated in LAP1-associated diseases. Biochem Biophys Rep. 2024 Jun 26;39:101757. doi: 10.1016/j.bbrep.2024.101757.
- Pereira CD, Espadas G, Martins F, Bertrand AT, Servais L, Sabidó E, Chevalier P, da Cruz E Silva OAB, Rebelo S. LAP1 Interactome Profiling Provides New Insights into LAP1’s Physiological Functions. Int J Mol Sci. 2024 Dec 10;25(24):13235. doi: 10.3390/ijms252413235.
- Smeets H, Verbrugge B, Bulbena X, Hristova L, Vogt J, van Beckhoven I; all participants; Patient organizations/patient representatives: LAMA2-Europe, Voor Sara-the Netherlands, ImpulsaT-Spain, LAMA2-France, CMD-Turkey, LAMA2-Bulgaria, Cure-CMD. European Joint Programme on Rare Diseases workshop: LAMA2-muscular dystrophy: paving the road to therapy March 17-19, 2023, Barcelona, Spain. Neuromuscul Disord. 2024 Mar;36:16-22. doi: 10.1016/j.nmd.2024.01.001.
- Perrin A, Métay C, Savarese M, Ben Yaou R, Demidov G, Nelson I, Solé G, Péréon Y, Bertini ES, Fattori F, D’Amico A, Ricci F, Ginsberg M, Seferian A, Boespflug-Tanguy O, Servais L, Chapon F, Lagrange E, Gaudon K, Bloch A, Ghanem R, Guyant-Maréchal L, Johari M, Van Goethem C, Fardeau M, Morales RJ, Genetti CA, Marttila M, Koenig M, Beggs AH, Udd B, Bonne G, Cossée M. Titin copy number variations associated with dominant inherited phenotypes. J Med Genet.2024 Mar 21;61(4):369-377. doi: 10.1136/jmg-2023-109473
- Benarroch L*, Madsen-Østerbye J*, Abdelhalim M, Mamchaoui K, Ohana J, Bigot A, Mouly V, Bonne G, Bertrand AT*, Collas P*. Cellular and Genomic Features of Muscle Differentiation from Isogenic Fibroblasts and Myoblasts. Cells. 2023 Aug 3;12(15):1995. doi: 10.3390/cells12151995. Co-first and Co-Last authors.
- Gregory EF, Kalra S, Brock T, Bonne G, Luxton GWG, Hopkins C, Starr DA. Caenorhabditis elegans models for striated muscle disorders caused by missense variants of human LMNA. PLoS Genet. 2023 Aug 25;19(8):e1010895. doi: 10.1371/journal.pgen.1010895.
- Cannie DE, Syrris P, Protonotarios A, Bakalakos A, Pruny JF, Ditaranto R, Martinez-Veira C, Larrañaga-Moreira JM, Medo K, Bermúdez-Jiménez FJ, Ben Yaou R, Leturq F, Mezcua AR, Marini-Bettolo C, Cabrera E, Reuter C, Limeres Freire J, Rodríguez-Palomares JF, Mestroni L, Taylor MRG, Parikh VN, Ashley EA, Barriales-Villa R, Jiménez-Jáimez J, Garcia-Pavia P, Charron P, Biagini E, García Pinilla JM, Bourke J, Savvatis K, Wahbi K, Elliott PM. Emery-Dreifuss Muscular Dystrophy 1 is associated with high risk of malignant ventricular arrhythmias and end-stage heart failure. Eur Heart J. 2023 Aug 28:ehad561. doi: 10.1093/eurheartj/ehad561.
- Stojkovic T, Masingue M, Métay C, Romero NB, Eymard B, Ben Yaou R, Rialland L, Drunat S, Gartioux C, Nelson I, Allamand V, Bonne G, Villar-Quiles RN. LAMA2-Related Muscular Dystrophy: The Importance of Accurate Phenotyping and Brain Imaging in the Diagnosis of LGMD. J Neuromuscul Dis. 2023;10(1):125-133. doi: 10.3233/JND-221555.2022.
- Denommé-Pichon AS, Matalonga L, de Boer E, Jackson A, Benetti E, Banka S, Bruel AL, Ciolfi A, Clayton-Smith J, Dallapiccola B, Duffourd Y, Ellwanger K, Fallerini C, Gilissen C, Graessner H, Haack TB, Havlovicova M, Hoischen A, Jean-Marçais N, Kleefstra T, López-Martín E, Macek M, Mencarelli MA, Moutton S, Pfundt R, Pizzi S, Posada M, Radio FC, Renieri A, Rooryck C, Ryba L, Safraou H, Schwarz M, Tartaglia M, Thauvin-Robinet C, Thevenon J, Tran Mau-Them F, Trimouille A, Votypka P, de Vries BBA, Willemsen MH, Zurek B, Verloes A, Philippe C; Solve-RD DITF-ITHACA; Solve-RD SNV-indel Working Group*; Solve-RD Consortia; Orphanomix Group; Vitobello A, Vissers LELM, Faivre L. A Solve-RD ClinVar-based reanalysis of 1522 index cases from ERN-ITHACA reveals common pitfalls and misinterpretations in exome sequencing. Genet Med. 2023 Apr;25(4):100018. doi: 10.1016/j.gim.2023.100018. *I. Nelson as I as part of Solve-RD SNV-indel Working Group*
- Yaldiz B, Kucuk E, Hampstead J, Hofste T, Pfundt R, Corominas Galbany J, Rinne T, Yntema HG, Hoischen A, Nelen M, Gilissen C; Solve-RD consortium*. Twist exome capture allows for lower average sequence coverage in clinical exome sequencing. Hum Genomics. 2023 May 3;17(1):39. doi: 10.1186/s40246-023-00485-5. *G Bonne, T Evangelista, V Allamand, I Nelson, R Ben Yaou, C Metay, E Cohen, A Atalaia, T Stojkovic as part of Solve-RD consortium.
- Jackson A, Lin SJ, Jones EA, Chandler KE, Orr D, Moss C, Haider Z, Ryan G, Holden S, Harrison M, Burrows N, Jones WD, Loveless M, Petree C, Stewart H, Low K, Donnelly D, Lovell S, Drosou K; Genomics England Research Consortium; Solve-RD consortium*; Varshney GK, Banka S. Clinical, genetic, epidemiologic, evolutionary, and functional delineation of TSPEAR-related autosomal recessive ectodermal dysplasia 14. HGG Adv. 2023 Mar 3;4(2):100186. doi: 10.1016/j.xhgg.2023.100186. *G Bonne, T Evangelista, V Allamand, I Nelson, R Ben Yaou, C Metay, E Cohen, A Atalaia, T Stojkovic as part of Solve-RD consortium
et
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Bonne+G
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Allamand+V
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Bertrand+AT
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Nelson+I