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PLATEFORMES – UNITéS TECHNOLOGIQUES
Imagerie du vivant
La plateforme MyoImage développe des scripts d’analyse d’images et accompagne les utilisateurs pour le maniement des logiciels de pilotage des microscopes afin de programmer l’acquisition et l’analyse d’images personnalisées
Plateforme MyoImage
La plateforme Myoimage est dirigée par Bruno Cadot, PhD, chercheur au Centre de Recherche en Myologie de l’Institut. Elle a pour objectif de répondre aux attentes des différents chercheurs en termes d’imagerie en offrant le maximum de possibilités d’imagerie tout en répondant à des exigences de qualité.
Vert : Microtubules, Jaune : Nesprin-1, Rouge : Appareil de Golgi, Bleu : Noyau (©B. Cadot)
La plateforme propose des équipements d’imagerie de pointe et d’analyse d’images offrant un maximum de possibilités d’imagerie, tout en répondant à des exigences de qualité, via différentes approches, de l’infiniment petit, avec la microscopie électronique, jusqu’à la microscopie classique avec le champ large. Pour le criblage à moyen débit, plusieurs microscopes sont entièrement motorisés. Par ailleurs, deux systèmes permettent de suivre les cellules vivantes sur le long terme, et deux autres systèmes offrent la possibilité d’obtenir des images en fluorescence avec une résolution maximale. Enfin, l’acquisition récente d’un holotomographe rend possible l’observation de cellules vivantes avec une résolution équivalente à un confocal mais sans marquage fluorescent.
Par ailleurs, MyoImage développe des scripts d’analyse d’images, spécifiques entre autres à la myologie, grâce à des logiciels Open Source, tels que FiJi, Python, Qupath, Cell Profiler et accompagne également les utilisateurs dans l’utilisation des logiciels NIS, Zen et Metamorph.
En 2025, la plateforme MyoImage a répondu aux besoins de 30 projets d’analyse d’images (1 à 10 To de données), impliquant 71 personnes, et mené un projet externe en collaboration avec l’Institut de recherche Sant Joan de Déu à Barcelone (Espagne).
Matériel
- Un microscope confocal dernière génération Nikon AXR-NSPARC assorti d’un module de super résolution N-STORM
- Un microscope confocal spinning Nikon Ti-2 équipé du LiveSR, de deux caméras, d’une chambre d’incubation
- Un microscope champ large Nikon Ti, équipé d’une chambre d’incubation.
- Un microscope à holotomographie NanoLive, équipé d’une chambre d’incubation
- Un microscope champ large Zeiss équipé du module Apotome.
- Un microscope champ large Zeiss Axio Observer
- Un Incucyte Sartorius qui permet un suivi dans la durée de plusieurs plaques de culture
- Deux microscopes à fluorescence Life technologies Evos
- Un microscope Keyence VHX-S750 pour les colorations chimiques
- Un microscope électronique Phillips CM120
- Deux stations d’analyses d’images avec des cartes graphiques adaptées à l’IA
Cyan : Membright, Magenta : SiRActin (©B. Cadot)
Composition de l’équipe
Bruno Cadot : Responsable
Zoheir Guesmia : Responsable adjoint