PLATEFORMES – UNITéS TECHNOLOGIQUES

Données / IA

La plateforme MyoData fournit aux chercheurs et aux cliniciens de l’institut un soutien structurel et une expertise en matière de traitement, d’intégration, d’analyse de données et d’IA de la conception de l’étude à l’interprétation des données

Plateforme MyoData

La plateforme MyoData, dirigée par Maxime Jacoupy, PhD, rassemble une équipe pluridisciplinaire ayant pour socle commun l’expertise en matière de Data.

MyoData fournit aux chercheurs et aux cliniciens de l’Institut de Myologie un soutien structurel et une expertise en matière de traitement, d’intégration et d’analyse de données, de la conception de l’étude à l’interprétation des données.

Cinq domaines clés délimitent le champ d’intervention de MyoData : le data management clinique, la gestion de projet axée sur les données, le data management technique, la bio-informatique et la bio-statistique.

A plus long terme, la plateforme a pour objectif de fournir des solutions intégrant l’Intelligence Artificielle et de proposer des services de gestion des données cliniques.

Expertises

Data management 

  • Gestion et organisation des données
  • Sécurité, qualité et conformité des données
  • Support technique et gestion des infrastructures

Bio-informatique

  • Analyse des données OMIQUES
  • Développement d’outils et de ressources bio-informatiques
  • Collaboration et soutien aux chercheurs

Biostatistique

  • Conception et planification des études
  • Analyse et interprétation des données
  • Communication et collaboration

Gestion de projet data 

  • Planification et organisation des projets
  • Coordination et communication
  • Design d’eCRF (electronic Case Report Form)

Stack technique 

  • Langages de programmation et environnements de développement : Python ; R ; Jupyter Lab ; MATLAB ; Bash
  • Bases de données et langage de requête : SQL
  • Outils d’analyse statistique : SAS ; SPSS ; Prism GraphPad
  • Gestion de versions et collaboration : Git
  • Plateformes et services cloud : Microsoft Azure ; AWS
  • Outils de gestion de données cliniques et de recherche : CleanWeb ; REDCap
  • Outils de workflow et d’orchestration : Nextflow

MyoData Hub 

MyoData Hub est un d’entrepôt de données de santé (EDS) dédié aux données sur les muscles, réalisé en conformité avec les attentes de la CNIL. En plus d’améliorer la sécurité et l’accessibilité aux données, le Hub permet de faciliter la recherche, le diagnostic et les soins des patients.

Cette plateforme centralise l’ensemble des données de santé collectées par l’Institut de Myologie, et grâce à sa compatibilité avec d’autres sources de données, rend possible des analyses variées en utilisant des outils avancés et l’expertise de collaborateurs externes. Il permet également d’assurer la conformité des pratiques de sécurité et de qualité des données, en respectant les réglementations en matière de protection des données et de confidentialité. MyoData Hub rend ainsi la gestion des données musculaires plus sécurisée, organisée et efficace, favorisant ainsi une meilleure prise en charge des patients et le progrès de la recherche. 

Composition de l’équipe

Maxime Jacoupy, PhD, Responsable de la plateforme
Frédéric Fer, MS, Biostatisticien
Rebecca Goulancourt, MSc, Bioinformaticienne
Maria Kondili, MSc, Bioinformaticienne
Flora Lasserre, Msc, Cheffe de projet
Nathalie Peillod, MS, Cheffe de projet data, Data Manager Clinique
Natalia Pinzon, PhD, Bioinformaticienne

Contact : myodata@institut-myologie.org