MyoMiner : une base de données pour explorer la co-expression de gènes dans le muscle normal et pathologique

La compréhension des maladies neuromusculaires héréditaires passe en priorité par l’étude de l’ADNmacromolécule complexe, l’ADN est le support de l’hérédité (gènes). C’est le constituant des chromosomes. L’ADN est organisé en double hélice (deux brins complémentaires) et constitué de nucléotides de quatre types : adénine, guanine, cytosine et thymine. génomique et la recherche d’anomalies à ce niveau. Pour autant, les étapes ultérieures consistant, à partir du gèneSéquence d’ADN constituant une unité d’information génétique. Un gène code une protéine assurant une fonction précise. Le gène contient des séquences codantes (exons) et des séquences non codantes (introns)., à la production de transcrits (ARNmacromolécule constituée d’une seule chaîne de nucléotides (simple brin) résultant de la transcription (copie) de l’ADN. messagers) puis à l’élaboration minutieuse de protéines sont tout aussi cruciales. À la grande variété des gènes se conjugue en effet une variété encore plus grande au niveau protéique du fait, notamment, de l’épissage alternatif. Ceci revêt une grande importance à la fois pour la physiopathologie et  pour la recherche de nouvelles thérapies.

Dans un article publié en mai 2020, des chercheurs européens coordonnés par l’Institut de Myologie de Paris, font état de la mise à disposition de la communauté scientifique d’un outil, le Myominer, destiné à mieux comprendre l’expression des gènes au niveau protéomique. Le Myominer est une base de données issue des profils d’expression protéique dans le muscle de souris à l’état normal ou dans un cadre pathologique. Libre d’accès, on peut facilement l’interroger en ligne et établir ainsi des probabilités d’interaction entre les différentes protéines d’intérêt en étudiant leur co-expression, et remonter aux gènes correspondants si nécessaire. La valeur ajoutée de Myominer repose beaucoup sur le nombre et la variété des échantillons biologiques ayant servi  à établir les différents profils protéomiques.

MyoMiner: explore gene co-expression in normal and pathological muscle. Malatras A, Michalopoulos I, Duguez S, Butler-Browne G, Spuler S, Duddy WJ. BMC Med Genomics. 2020 May 11;13(1):67. doi: 10.1186/s12920-020-0712-3.